L'entreprise COPAS a installé en 2023 deux ascenseurs défaillants à la gare de Saint-Jean-de-Losne. Ces ascenseurs ont connu 3 pannes longues (plusieurs semaines) sur l'année 2024, et sont actuellement en panne depuis octobre soit près de 3 mois. L'absence de réparation garantissant le bon fonctionnement du matériel sur le long terme empêche aujourd'hui l'usage de la gare par toute personne à mobilité réduite alors qu'il s'agit de la seule gare équipée sur la ligne Dijon-Seurre. Cela rend également très difficile l'intermodalité train-vélo alors que le TER permet de transporter son vélo gratuitement, et que la gare est située à 2km des communes de Saint-Usage et Saint-Jean-de-Losne et permet de desservir deux axes cyclotourisiques majeurs (Canal de Bourgogne et Voie Bleue).